Covid-19 • Chiffres et Courbes en France

Par Guillaume Promé
le 6 Jan. 2022 • Covid 19
[article initialement publié le 15 mars 2020, les données ne sont plus mises à jours depuis juillet 2022]

Suivi de l’épidémie de covid-19 en France, via les principaux chiffres : données hospitalières, vaccination, risque, R effectif… La mise à jour des courbes est automatique.

Les analyses sont majoritairement relatives : les chiffres bruts sont ramenés aux populations concernées.

Le calcul des risques utilise les techniques de la norme XP S99-223, le niveau de risque est calculé selon les données hospitalières, il varie de 5 (catastrophique) à 0 (très faible). Le risque évolue de façon exponentielle (risque = 10Niveau). Un niveau à 5 pendant un an signifie 100% de décès, 10% à 4, 1% à 3 …
5 niveaux de risque

Situation courante

Risque courant pour chaque groupe, en % du maximum depuis le début de la crise, selon les données hospitalières.

Courbes des 4 dernières semaines

Courbes de la covid en France : nouvelles hospitalisations, nouveaux décès, saturation des réanimations et R effectif.

1. L’épidémie de covid en France

Visualisation de la croissance hebdomadaire des nouvelles hospitalisations :

Les hospitalisations augmentent-elles de façon exponentielle ?

Une épidémie est par nature exponentielle, le phénomène se nourrissant de lui-même (ex : une personne en contamine 2 qui en contaminent 4, puis 8 …). Aussi, les phases de montée et de hausse des hospitalisations sont toujours exponentielles, elles durent de 1 à 3 mois. Des mesures de maitrise type confinement nécessitent deux semaines pour pouvoir passer d’une croissance à une décroissance.

2. Niveau de risque par région

Une projection est calculée selon les tendances des quatre dernières semaines.

👉 Cliquez pour sélectionner une région.

annexe 1: Épidémie en France

Pression hospitalière, Seuils de Confinement et de Couvre-feu

La courbe de pression hospitalière est proportionnelle à la mortalité hospitalière et au taux d’occupation en réanimation.

Âge moyen des patients

Estimation de l’âge moyen des patients : nouveaux cas, nouvelles hospitalisations, admissions en réanimation, nouveaux décés et nouveaux vaccinés.

Nouveaux cas selon l’âge

L’estimation des nouveaux cas réels tient uniquement compte du taux de positivité des tests réalisés en laboratoire. Les données sont ramenées à l’ensemble de la population, en considérant que 23% de la population était infectée au 09/04/2021 (source).

Edit juillet 2022 : le flux de données n’est plus disponible sur data.gouv.

Risque selon l’âge

Calcul du risque selon les données hospitalières, par tranches d’âge.

annexe 2: Vaccination

Primo-vaccinés dans le temps

Nombre de nouveaux primo-vaccinés dans le temps, par tranches d’âge.

Vaccination dans le Monde

Nombre de doses administrées par personnes: :

annexe 3: R effectif et activité sociale

R effectif et activité sociale

Le R effectif est, ici, calculé selon les taux de positivité des tests virologiques et taux d’incidence, il est pondéré par le nombre de nouvelles hospitalisations.
L’indicateur d’activité sociale est fortement corrélé avec le R effectif , il est calculé selon les données de mobilité fournies par Google, la mise à jour est manuelle.

Voir l’article détaillé.

On constate que les périodes avec une activité sociale significativement supérieure au R effectif sont souvent suivies d’une remontée du R effectif. Les écarts entre les deux indicateurs sont reportés en vert et en rouge sur la courbe.

Détails des activités sociales

Indicateurs calculés à partir des données de mobilité Google.

Comparaison du coronavirus avec d’autres risques

Les risques sont annualisés.

Formules

La majorité des calculs se fait sur la moyenne à 7 jours des indicateurs, pour tenir compte de la périodicité hebdomadaire des indicateurs (baisses les week-end). Le cas échéant, la population est à échelle nationale, régionale ou par tranches d’âge.
Croissance hebdomadaire des hospitalisations :
La (dé)croissance est calculée sur toute la durée d’une phase :

Croissance (%) = base(LOGREG(nombre de nouvelles hospi; jours))7 – 1

Calcul d’un niveau de risque :

NR = log( Σ Pi × Gi)

Avec Pi et Gi les probabilités et gravités des composantes du risque.
Niveau de risque hospitalier :

NR = log( Phospi × Ghospi + Préa × Gréa + Pdécès × Gdécès)

Avec :

Phospi = Hospitalisations / Population
Ghospi = log(moyenne(Décès / Hospitalisations à 7J) × 105)
Préa = Réa. / Population
Gréa = log(moyenne(Décès / Réa à 7J) × 105)
Pdécès = Décès / Population
Gdécès) = 5

Risque projeté dans le temps :
Prise en compte des dernières valeurs disponibles :

NR projeté à 14 jours (J) = Courbe de prévision(J; 14 derniers NR disponibles; 14 derniers jours disponibles)
28 est utilisé au lieu de 14 pour des projections à 4 semaines.

 
Pression hospitalière :

Pression hospi. = 100 × taux occupation réa × décès quotidiens / hospitalisations courantes

 
Indicateur d’activité sociale :
Selon les indicateurs de mobilité Google.

[ ] indique une matrice
Activité = [coefficients][indicateurs mobilité]

Les coefficients sont calculés pour une corrélation maximale entre l’activité et le R effectif sur la période de 2020 :

[coefficients] = résolution par moindres carrés([indicateurs mobilité]; R effectif)

Liens

Sources

La plus grande faiblesse de l’espèce humaine vient de son incapacité à comprendre la fonction exponentielle

Albert Allen Bartlett

Crise du coronavirus en France: années 2020, 2021 et 2022:

Une bande = 3 jours.