Analyse et Suivi : La Covid-19 en France et dans le monde

22 septembre 2020 Coronavirus, Risques 20 commentaires
[article publié le 15 mars, mise à jour régulière]

Analyse des risques associés au Coronavirus, en France et dans le Monde, par les chiffres :

  • Cartes départements France et Pays du monde,
  • Courbes des nombres de cas dans le temps (décèscas confirmés, données hospitalières, urgences et SOS médecin),
  • Surveillance de la 2eme vague et du risque de reconfinement,
  • Estimations et suivis des risques.

Pour ne pas dépendre des politiques de test : les cas dépistés ne sont pas intégrés aux calculs, uniquement les données hospitalières, urgences et SOS médecin.

Cette analyse ne repose pas sur un modèle : l’analyse des risques est un constat, réalisé selon des indicateurs, calculés avec les données et statistiques fournies. Voir les formules utilisées.

Articles associés :

Courbes du coronavirus en France

Cas quotidiens synchronisés

Nombre de nouveaux cas quotidiens, tout indicateur.
Attention :
  • les données sont synchronisées (pour une corrélation maximale entre les courbes) : cela permet de tenir compte du décalage constaté entre les différents indicateurs.
  • Le nombre de nouveaux cas est corrigé jusqu’à mi juin 2020, pour tenir compte du très faible nombre de tests réalisés lors de la première vague.

On notera le retard des indicateurs les plus utilisés dans les médias : décès et réanimation.

Si la dynamique ne se calme pas d’ici mi-septembre, un reconfinement est probable pour octobre.

Solde hospitalier

Pour chaque jour : solde = (entrées / sorties) – 1 = nouvelles hospitalisations /(( décès + retours au domicile) -1).
Avec un solde négatif les hôpitaux se vident, avec un solde positif ils se remplissent.

Avancement / Fin de la crise covid

Calculé selon les données hospitalières : à la fin de la crise les hôpitaux seront vides de patients covid, l’indicateur sera à 100%.

Projections des décès sur une semaine

Calculé en tenant compte des activités hospitalières, urgence et SOS médecin.

Suivi de la seconde vague en France

Suivi de l’activité sociale des Français

Utilisation des données fournies par Google : un risque est associé à une activité sociale forte (transports, commerces, travail…) un bénéfice est associé au confinement à domicile, la courbe représente le rapport bénéfice/risque.

Activité du virus : taux de reproduction R0

Indicateur dans l’esprit du taux de reproduction de base R0, mais très simplifié.
Calcul : évolution des cas sur 7 jours, déphasage pour maximiser la corrélation avec les nouvelles hospitalisations.

Ratio nouvelles réa / nouveaux décès

Le rapport nouvelles admissions en réanimation / nouveaux décès est supérieur à 1 en phase de montée du risque, inférieur à 1 sinon.

Cartes du Coronavirus en France

Carte : décès et hospitalisations cumulés

La taille des points est proportionnelle au taux cumulé de personnes hospitalisées, la couleur reflète la mortalité hospitalière cumulée.

Carte : situation courante

La taille des points est proportionnelle au taux courant de personnes hospitalisées, la couleur reflète la mortalité hospitalière potentielle (fonction de la mortalité hospitalière cumulée et du nombre de patients actuellement hospitalisés).

Le coronavirus dans le monde

Progression du virus : taux de contamination

Cette carte représente le taux de contamination dans chaque pays, attention : cela dépend de la progression du virus mais également des efforts de dépistages et des politiques de transparence, qui sont loin d’être homogènes.

Taux de mortalité pour la population

Cette carte représente le taux de décès dans chaque pays, indépendamment du dépistage réalisé. Attention : selon les pays les décomptes incluent tous les décès associés à la covid (en cause principale ou secondaire) ou uniquement les décès ayant la covid pour cause principale. De même, la transparence des pays sur le nombre de décès est loin d’être homogène.
Les données de pays comme la France sont particulièrement exhaustives, en incluant notamment les Ehpad, ce n’est pas le cas de tous les pays.

Taux de cas terminés

Cette carte représente la part de décès et de cas guéris parmi tous les cas confirmés: ce sont les cas terminés.

Tendances et mortalité potentielle

La tendance représentée tient compte du risque patient ainsi que du nombre de cas actifs (les patients toujours hospitalisés), un nombre potentiel de décès est précisé en info-bulles, en appliquant le taux de mortalité au nombre de cas actifs.

Analyse des risques en France

Carte des risques pour la population

Niveau de risque en fonction de l’âge et du sexe

Le risque augmente avec l’âge, il est supérieur pour les hommes.

Risque population

Le risque quotidien prend en compte tous les indicateurs quotidiens, il est néanmoins fortement influencé par le taux de décès.

Risque patient

Fonction de la mortalité hospitalière.

Corrélation R0 / Activité sociale

Met en évidence que la transmission du virus est fortement conditionnée par les activités sociales des Français.
L’avance des données sur l’activité permet d’anticiper les variations du taux de reproduction sur une semaine.

Annexes

Intérêt pour le coronavirus en France

Comparaison avec d’autres risques, sur une période d’un an

Les risques sont annualisés. (notamment : risque de décès pendant la seconde guerre mondiale, calculé à partir des décès sur 5 ans divisés par 5)

Déphasages utilisés pour les courbes de cas en France

Calculs des risques

Niveau de contamination

  • NPpop cas = log(cas/pop.105) : [cas/pop]
  • Lecture : une variation de 1 de NP équivaut à une variation de 1 à 10 pour le taux de contamination.
  • NP = 5 à 100%, 4 à 10%, 3 à 1% …

Niveau de mortalité

  • NRpop = log(décès/pop.105) : [décès/pop]
  • Lecture : une variation de 1 de NR équivaut à une variation de 1 à 10 pour le taux de décès.
  • NR = 5 à 100%, 4 à 10%, 3 à 1% …

Niveau de cas terminés

  • NPpat fini = log((décès+sorties)/cas.105) : [(décès + sorties)/cas]
  • Valeur minimale bridée pour une meilleure lisibilité

Tendances / Niveau de mortalité potentielle

  • NPpat actif = log(actif/cas.105) : [actif/cas]
  • NTendance = NPpat actif + NRpat – 5 : [actif.décès/cas²]

Sources

  • Données quotidiennes France : santé publique France
  • Indicateurs du gouvernement
  • Géodes : données hospitalières, décès, dépistages, urgences et SOS médecin
  • Recherche autour du sujet Coronavirus sur Google : lien
  • Données Google relatives au respect du confinement : lien
  • Données monde : worldometers

La plus grande faiblesse de l’espèce humaine vient de son incapacité à comprendre la fonction exponentielle

Albert Allen Bartlett